Anna’s mom より:

こんばんは、Akiさん。
Junさんじゃなくて申し訳ないのですが、私なりに回答させてください。
というのも、明日はいよいよ July 4th でJunさんは忙しいのではないかとも思うからです。（笑）
私も明日は友人とお祝いします。Happy Birthday America!

と雑談はさておき、まず回答する前に、今後Akiさんが何か疑問に思った時、助けになるように、いくつかアドバイスをさせてください。

１.英英辞典を使う事をお勧めします。お仕事で英語を使用されているという事なので、英英辞典を引いて理解する力はついていると思います。私は、留学中にアメリカの友人が勧めてくれた、dictionary.com を使用してます。

２.この質問はニュアンスについての質問になってくるので、是非英会話スクールでネイティブに習うか、tutorをつけるべきだと思います。とくに、いま質問されている内容は、声のトーンや何度も例文を交えて、いろんな状況で繰り返し練習しないと、言葉だけでの説明では理解でき無い部分があるからです。あと、話し言葉とビジネス等のメールの英語は違う部分があるのでその辺も、ベジネスで英語を使うなら、きちんとこのサイト以外にも聞ける確かな人を作って学んだほうが、きっとアキさんご自身が安心して、仕事で英語を使えると思うからです。

本当はお勤めされている会社で、お客様との間でのトラブルを防ぐ為、英語圏出身、もしくは帰国子女を１人でも雇うべきだとも思ってしまいます。。。これはアキさんの問題では無いですが。。。

で、私なりに勉強した事やアメリカの友人との会話を思い出して、私なりの解釈と英英辞典を今一度みたり、英語サイトで調べた内容を交えて回答させていただくと。
まずは、willを英英辞典で引くと以下の意味が出てきます。

1.am (is, are, etc.) about or going to:
I will be there tomorrow. She will see you at dinner.

2.am (is, are, etc.) disposed or willing to:
People will do right.

3.am (is, are, etc.) expected or required to:
You will report to the principal at once.

4.may be expected or supposed to:
You will not have forgotten him. This will be right.

5.am (is, are, etc.) determined or sure to (used emphatically):
You would do it. People will talk.

6.am (is, are, etc.) accustomed to, or do usually or often:
You will often see her sitting there. He would write for hours at a time.

7.am (is, are, etc.) habitually disposed or inclined to:
Boys will be boys. After dinner they would read aloud.

以下質問と回答
＞willの 2)未来の出来事に確信を持つ時の使い方と
be going toの 2)現状に基づいて今後の出来事を予想する時の使い方がどちらも同じ？

この２つは違います。
簡単に言ってしまうと、willの確信というのは、主観で確信しているという事だと思います。
よってこのwillは英英辞典の５の意味にあたります。

be going toの今後の出来事というのは、自分の単なる前もって立てられた”計画”について話してるだけです。

で、もしかしたら、こちらで紹介されている例文と意味がが少し、誤解を招く部分がある気がするので、It will rain tomorrow.をもう少し細かく見たいと思います。
例えば、明日は雨が降るでしょうをis going to で表すと、明日は雨が降る事が計画されています。というニュアンスに聞こえるので変ですよね。なので、willです、でもこのwillは100%でないwillで英英辞典の４の意味に該当するwillで、sure toの5確信のwillでは無いと思います。天気予報で雨が明日降るのが計画的に予定されていて、100%降る、なんてことはあり得無いですよね。

よってAkiさんの質問の納期の連絡についてwill かbe going toどちらが適しているか、ですが受注を頂いてから、商品の発送まですでにもう”計画”が立っていて、納期の日が決まっているならbe going to を私は使います。

そこである人に言われたという「強い確信がある場合はwillを使うほうがいい」というのは、英語圏出身の人に言われましたか？もし、英語圏の人に英語で質問して、回答頂いたのなら、きちんと状況を十分に説明されましたでしょうか？日本語のあまり分からないネイティブに教えてもらう時には、日本語でも英語でも細かく状況を説明しないと、自分の言いたい言い回しは教えてもらえ無い事が多いいです。これが、Junさんのようなバイリンガルに聞くメリットですが。。でこの方の言っているwillは英英辞典の5の意味です。そこで、この3,4番の意味のwillが納期を知らせるのに適切か。。という事ですが、私はwill自体があまり適して無いように感じます。（ここはJunさんの意見を聞きたいところですが。。）では、どう表現したらいいのかですが、アメリカが本社のサイトで買い物をすると、confirmationのメールが届いて”商品の名前 is expected to arrive by/within/“とかなります。なので、Akiさんももし、よければアメリカのHPでショッピングされて、やりとりを学ぶのもいいかもしれません。ビジネスの場合は特にネイティブからいろんな表現を学ぶのがいいと思います。あまり、日本語訳に惑わされて、型にはまった表現で返しては、誤解を招くかもしれません。１つの事には何通りもの言い回しがあり、状況によって言葉を選んで使います。そして、日本語訳は参考訳くらいに考えて、必ず英英辞典を見るようにしたほうが、ニュアンスに確かな確信が持てます。

＞be going to の使い方の例にあった
It’s going to be a beautiful day.や、
It’s going to be about 45 minutes.は、
It will be a beautiful day.
It will be about 45 minutes.とは言わないのでしょうか？

この質問に関しては、すべてはcontextです。状況により自分が何が言いたいのかによって、使い分けが必要な文章です。
It’s going to be a beautiful day.はこのページの例文にもあるようにThere is not a single cloud in the sky. というcontextがあるのでbe going to ですし、It will be a beautiful day.と言う時の状況を考えると、きっと、It is cloudy now but it will(I’m not sure多分) be a beautiful day.と言えると思います。他の２つの質問された文も同じ事です。よって言わ無いのではなくて、例に出されたすべての文は使う事ができるけど、すべてはcontextだと言う事です。

いつも長々とコメントすみません。ニュアンスに関しては特に説明が必要なので、つい細かくなりましたが、是非参考にしていただければ幸いです。

Akiさん　お仕事、英語の勉強頑張って下さい。
偉そうに、説明してしまいましたが、まだまだ私も勉強が必要です。
今回は回答する事で勉強させてもらいました。私も英語の勉強頑張ります。